种苗选择是石斛产量多少和品质好坏的基础。在选择石斛种苗的时候会看到有一级苗和二级苗之分，它们的区别就在于驯化的时间不一样。等级较高的石斛苗驯化时间在四个月之上，等级低的驯化时间低于四月。
如果选择了没有驯化过的种苗，在种植初期，需要做一些炼苗和出瓶的准备。所谓炼苗，就是取出瓶中的苗然后放到炼苗房开始3周的炼苗，目的是为了让它适应新的环境。使它生长为叶色正常，肉质茎有4个节左右的健壮种苗，拥有的一定的抵抗力。在出瓶的时候需要把植物取出放到清水中，把根上面的琼脂洗掉，并把裸根苗和少根苗分别放置，减少污染的可能性。
在种植的前后一个月内，管理同样很重要。在这期间，最主要的目的就是除菌，故需要每3天左右做一次杀菌的喷洒工作。温度也要控制得当，一般在28度左右即可，目的是为了保证细菌的繁殖。