每年4-5月及9-10月的气候条件都适合进行百香果扦插育苗，选取来源清楚、品种品系纯正、生长壮健、丰产优质、无病毒病症状的植株，或该植株的扦插苗不出圃留下专供剪插条的植株（根据育苗数量而留下的数十株至数百株植株，在网室隔离栽培）采集插条。插条段应是上一年或上半年吐芽生长老熟、叶片完整、芽眼饱满的枝条。
建议每条茎段一般应包含3个节，长15~20厘米，下端剪口应剪在节下端0.5厘米处，上端剪口应剪在芽眼上方1厘米处，茎段只留上端一片叶，并剪去叶片的一半，下端两片叶及卷须剪除，下端斜削面与上端芽眼相平行，刚好保留节段的2/3，有利于生根，所用的刀、剪应保持干净及锋利，以免剪削时挤压伤及枝条其他部位，影响长根及吐芽。
插床的土壤准备与实生苗培育有同样的要求，但因每枝插条下端的斜削口较大，且伤口的上方是吐根部位，伤口若遭病菌感染就难长根，因此插床上面应用多菌灵、代森锰锌进行消毒。
插床畦面宽1米，高出畦沟面20厘米，仔细松碎土层深至30厘米，按每100千克土量施人有机肥1~2千克，0.5千克含氮、磷、钾各15％的复合肥充分混合，放置1个月后备用。
插条扦插前，其下端1/3用0.01%ABT生根剂水溶液浸泡约5分钟后，立即进行扦插，按株距5厘米，行距15厘米，将扦插段卜骊2/3插入床土中，在苗床上用竹片搭简易弓形架，晴天阳光太強时可拉黑网纱挡光，暴雨前拉防雨透明薄膜防雨水冲刷，天气十早时，及时洒水保持床土湿润，暴雨后及时排水，防止苗床浸水越过8~10小时。在这样的条件下，插条约1个月即会长根吐芽。大正常时，即可卷好黑网纱及防雨膜，让扦插苗自然生长，隔15~20大施一次含0.2％尿素＋0.2％硫酸钾（或0.159％的氯化钾）的水肥促长。苗床露天过冬时要注意覆膜防寒。9-10月扦插至翌年3一4月苗木已长出10~12片真叶时即可定植至果园。
有的地方当扦插苗第一批萌吐的新芽展叶老熟后即移人塑料袋培育袋苗，使苗木的根系保持得更完整，定植成活率更高，长得更快，开花结果更早。